몇 년 전 세일러 비너스로 활동한 카렌 카나자키는 빛의 요정이 깃든 브로치의 힘으로 세일러 이시타르로 변신한다. 괴물 관련 범죄를 다루는 특수 조사관으로, 언니처럼 따르는 리사와 함께 수없이 많은 범죄자를 잡아들였다. 그러나 어느 날, 교도소에서 죄수 탈출 사건이 발생하고 리사도 끌려가 버린다. 카렌이 계속해서 수사를 진행하면서, 상관 안자이가 적에게 정보를 흘렸을지도 모른다는 의구심이 커져만 간다. 혼란에 빠진 그녀 앞에, 이름은 팔필리오라 하는 신비로운 여성 마법사가 나타나 충격적인 모습을 드러낸다. 리사가 포로로 잡혀 사이보그로 개조되고 브레인워싱까지 당한 상태였다.