마이하라 마이카는 수줍고 소극적인 고등학생이다. 어느 날, 그녀의 동네에서 일련의 납치 사건이 발생하고, 그중 유일하게 본인과 관련된 인물까지 납치되자 극심한 불안과 공포를 느낀다. 결국 오랜 시간 동경해온 천재 연구원이자 어릴 적 친구인 타치바나 레이에게 도움을 요청한다. 레이는 자신이 개발한 사이버 무기 <시안>을 그녀에게 건네주며 사건 해결에 나서기 시작한다. 그러나 그녀의 모든 행동은 사실 레이 본인이 치밀하게 꾸민 덫의 일부였다. 마이카가 눈치 채지 못하는 사이, 이야기는 예기치 못한 방향으로 흘러가기 시작한다.