지가의 초차원 전함 바빌론에서 아스카가 지구로 강하하면서, 아미는 급히 그녀를 돕기 위해 달려간다. 한편, 아스카는 세계적인 공학 권위자인 모로스미 박사를 노리는 우주 범죄 조직 분단과 맞서 싸운다. 아스카는 예지몽을 받지만, 아미는 신속히 지원에 나선다. 아스카가 스피리안과 치열하게 융합해 분단을 압도하며 박사를 성공적으로 구조한다. 그 순간, 스피리안을 향해 알려지지 않은 파괴적 힘이 접근한다. 과연 그 악몽이 현실이 되는 것일까? 아미의 반응이 끊기고, 아스카 역시…… 주인공의 몰락이라는 극한의 수치 속에 무너진다. 레퀴엠이 울려 퍼진다…… [나쁜 엔딩]