과학이 발전한 현대 사회의 어두운 그림자 속에서, 아야카시라 불리는 악령들이 숨어 번성하고 있다. 대중들은 모르는 사이, 인류를 위협하는 이 악의 세력을 조용히 소탕하는 전사들이 존재한다. 그들은 그림자 조작의 달인이자 어둠의 정복자, 아야카시 토메츠전사 코가이거다. 코가이거 유일한 여성 전사인 세이라에게는 신비한 보물을 수호할 신성한 임무가 주어진다. 홀로, 그녀는 약속된 장소에서 운명을 완수하기 위한 임무에 나선다. 그러나 그녀의 모든 움직임을 추적하는 새로운 아야카시 악령이 등장한다. 끊임없는 전투로 중상을 입은 세이라가 점점 빡빡해지는 위기 속에서 사투를 벌인다. 이제, 그녀의 시련 뒤에 숨겨진 진실과 궁극의 운명이 마침내 밝혀진다!