长达半世纪的边境冲突终于接近尾声。然而,漫长的战争已使国民身心俱疲,无数生命就此陨落。为了迎向新的和平,政府开发出名为「龙卷战甲」的特殊动力服武器系统,任务是寻找行踪成谜的莉莎·费兹杰拉德,并重新点燃人民的希望。经由电脑分析选定为最适任人选的美少女指挥官冈本真理亚,奉命投入战场。化身为「美少女指挥官 Cyber Rosa 红碧石」,她挺身前往战地。就在那里,她遇见一名流浪的年轻少女——然而,这名少女的真实本质,远比想像中更加邪恶。当冈本真理亚陷入尼洁洛的阴谋之际,等待她的,是一场残酷而毁灭性的命运……