암흑 조직 WSP가 세계를 위협하고 있다. 이에 대응해 국제방위기구는 그 존재를 알고 있는 자들에 의해 결성되어 각국에 지부를 설치하고, WSP를 소탕하기 위해 조사관들을 파견한다. 일본에서는 이미 체계가 완비되어 있으며, 조사관 마코는 WSP 일본지부의 대표 존슨이 만든 연쇄살인기계들을 연이어 격파하며 활약하고 있다. 그러나 전 세계적으로 WSP와 싸우는 조사관들은 그 압도적인 힘 앞에 무너져 하나둘씩 소멸되고 있는 실정이다. 이러한 위기 속에서 마코는 지금까지와는 차원이 다른 최대의 위협에 직면하게 된다. WSPJ003을 격파하고 귀환 회로를 확보한 마코는 대표 존슨의 은신처로 잠입하지만, 거기서 기다리고 있던 것은 바로 궁극의 살인기계 WSPJ004! 이전의 어떤 적보다 압도적인 속도와 힘을 지닌 WSPJ004는 마코를 무자비하게 몰아붙인다. 과연 마코는 대표 존슨이 만들어낸 걸작 WSPJ004를 물리치고 세계에 평화를 되찾을 수 있을 것인가?